Wednesday, January 4, 2012

[R][Rocks][CentOS] Rocks 5.3にRをインストール

Rocks 5.3には初めから統計ソフトRがインストールされていないため、自らインストールする必要がある。
(注)compute nodeでRを使う予定はないので、インストールする場所はデフォルトに従う。
ちなみに、OSのバージョンなどの確認出力は次の通り:
# cat /etc/redhat-release
CentOS release 5.4 (Final)
# uname -r
2.6.18-164.6.1.el5
# uname -m
x86_64

  1. rootでログインする。
  2. Rのrpmパッケージをダウンロードする。
    • Rのサイトからリンクを辿る。ここではredhat/el5/x86_64/と進む。
    • 次の5つのパッケージを/tmpにダウンロードした:
      R-core-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
      R-devel-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
      libRmath-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
      libRmath-devel-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
      R-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
  3. 上記のパッケージをインストールするために必要な他のパッケージをダウンロード・インストールする。
  4. R-coreパッケージをインストール:
    # rpm -ivh R-core-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
  5. R-develパッケージをインストール:
    # rpm -ivh R-devel-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
  6. libRmathパッケージをインストール:
    # rpm -ivh libRmath-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
  7. libRmath-develパッケージをインストール:
    # rpm -ivh libRmath-devel-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
  8. Rパッケージをインストール:
    # rpm -ivh R-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm

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