[R][Rocks][CentOS] Rocks 5.3にRをインストール

Rocks 5.3には初めから統計ソフトRがインストールされていないため、自らインストールする必要がある。

（注）compute nodeでRを使う予定はないので、インストールする場所はデフォルトに従う。

ちなみに、OSのバージョンなどの確認出力は次の通り：

# cat /etc/redhat-release
CentOS release 5.4 (Final)
# uname -r
2.6.18-164.6.1.el5
# uname -m
x86_64

1. rootでログインする。
2. Rのrpmパッケージをダウンロードする。
   
   • Rのサイトからリンクを辿る。ここではredhat/el5/x86_64/と進む。
   • 次の5つのパッケージを/tmpにダウンロードした：
     R-core-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
     R-devel-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
     libRmath-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
     libRmath-devel-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
     R-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
     
3. 上記のパッケージをインストールするために必要な他のパッケージをダウンロード・インストールする。
   
   • xdg-utils:
     
     1. DAG packages for Red Hat Linux el5 x86_64を/tmpにダウンロード。
     2. /tmpに移動し、端末で次を入力し、[Enter]キー：
        # rpm -ivh xdg-utils-1.0.2-2.el5.rf.noarch.rpm
   • perl(File::Copy::Recursive):
     
     1. perl-File-Copy-Recursive-0.38-1.el5.rf.noarch.rpmをこちらから/tmpにダウンロード。
     2. /tmpに移動し、端末で次を入力し、[Enter]キー：
        
        # rpm -ivh perl-File-Copy-Recursive-0.37-1.el5.rf.noarch.rpm
4. R-coreパッケージをインストール：
   # rpm -ivh R-core-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
5. R-develパッケージをインストール：
   # rpm -ivh R-devel-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
6. libRmathパッケージをインストール：
   # rpm -ivh libRmath-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
7. libRmath-develパッケージをインストール：
   # rpm -ivh libRmath-devel-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm
8. Rパッケージをインストール：
   # rpm -ivh R-2.10.0-2.el5.x86_64.rpm

【R】UbuntuにRをインストール

こちらのwikiを参照。

起動は端末で

$ R

と入力すればOK。

Rをインストール

　講義に使うかもしれないので、統計解析向けのプログラミング言語のRをインストール。versionは2.10.1。windows版だからexeファイルをクリックするだけでらくちんインストール。いちおう、Matlabと同じような使い方ができるフリーソフト。インタプリタ言語で遅いのでは？と思われるが、C/C++やFortranと連携することができるらしい。詳しい方法はわからないが。